O complexo do IMA em Franca reúne também uma indústria farmacêutica homologada pela ANVISA - Agência de Vigilância Sanitária Federal, que produz medicamentos fitoterápicos (um medicamento fitoterápico é aquele alcançado de plantas medicinais, onde utiliza-se exclusivamente derivados de droga vegetal tais como: suco, cera, exsudato, óleo, extrato, tintura, entre outros).
As plantas medicinais são produzidas num sítio localizado na região de Franca e seu processamento industrial é supervisionado pelo farmacêutico Wellington Berbel (CRF nº 36.350) Todos os remédios produzidos são distribuídos, gratuitamente, na farmácia do IMA ou enviados para qualquer parte do País ou exterior mediante o pagamento das taxas dos Correios.